Os itinerários formativos são a grande novidade do novo ensino médio e permitem aos estudantes aprofundar os conhecimentos em uma ou mais áreas de seu interesse. Os IFs, como são conhecidos, estão baseados em áreas do conhecimento (linguagens e suas tecnologias, matemática e suas tecnologias, ciências da natureza e suas tecnologias, ciências humanas e sociais aplicadas), ou na formação técnica e profissional.

No CSJT, por meio dos itinerários, é possível estimular a investigação científica, os processos criativos, o empreendedorismo, a mediação e a intervenção social. É possível, em termos práticos, desenvolver a capacidade de:

Para exemplificar, merecem destaque, dentre outros, alguns dos itinerários formativos ofertados pelo CSJT: Gêneros Textuais -Textos Criativos, Química Ambiental e Sustentabilidade, Seres Vivos e Saúde, Impactos Ambientais, Questões Socioculturais do Brasil, Projeto de Vida e Atitudes Empreendedoras etc.

O São Judas implementou o novo ensino médio há três anos. Ele é resultado da homologação da Base Nacional Comum Curricular, documento que baliza as principais competências a serem trabalhadas pelas escolas e traz orientações para a construção das novas matrizes curriculares. Além disso, permite aos estudantes um aprofundamento curricular maior, se comparado ao modelo antigo. O Colégio investiu fortemente na adequação das exigências à BNCC.